La flora y fauna de Malta no es muy rica. Las zonas verdes se componen básicamente de arbustos y matorrales, llamados aquí «Macchie». Los animales que habitan en la isla no son ni peligrosos ni venenosos.

Algunas de las especies que puebla la isla son el ratón, el erizo, el conejo, el murciélago, la comadreja y distintos tipos de serpientes no venenosas. Durante los meses de primavera y otoño, Malta se convierte en una estación importante para las aves migratorias. Aves que por desgracia se han convertido en objeto de caza debido al desarrollo en la isla del deporte de la caza de aves.

Las regiones combinan un paisaje, sobre todo en la isla principal, de zonas carstificadas con campos ajedreados en los que florecen pintorescas adelfas rojas y blancas durante los meses de verano. Los suelos están muy erosionados debido a la falta de arboledas. Apenas hay montaña, en cambio hay muchas cuevas y escarpaduras.